روز یکشنبه 25 خرداد ماه رژیم صیهونیستی به یکی از ساختمان های وزارت خارجه کشورمان حمله کرد، در این حمله بخشی از کتابخانه مرکز مطالعات وزارت خارجه نیز دچار آسیب شد و بخشهایی از این کتابخانه در آتش سوخت. سفارت ایران در آلمان نیز به این حادثه واکنش نشان داد و از آن با عنوان کتاب سوزیهای فاشیستی یاد کرد.
در سال 1310 هجری خورشیدی کتابخانهای اختصاصی در ساختمان مرکزی وزارت امورخارجه تاسیس شد تا شرایط لازم برای مطالعه و پژوهش در حوزههای سیاسی، تاریخی، حقوقی، اقتصادی و اجتماعی را برای کارمندان و منتسبین وزارت امورخارجه فراهم سازد. پس از تشکیل دفتر مطالعات سیاسی و بین المللی، کتابخانه دیگری در این مرکز مطالعاتی ایجاد شد که وظیفه خدمت رسانی به پژوهشگران و کارشناسان این مرکز را به عهده گرفت.
با گسترش روزافزون علوم اطلاع رسانی و لزوم بهرهمندی کارشناسان وزارت امورخارجه و مجموعه دانشپژوهان و اساتید حوزه علوم سیاسی و روابط بینالملل از آخرین دستاوردهای علمی ، وزارت امورخارجه برآن شد که با گردآوری و ساماندهی منابع نوشتاری و دیداری ـ شنیداری و با بهرهگیری از امکانات فناوری نوین اطلاع رسانی و اتصال به شبکههای اطلاعاتی داخلی و بین المللی، کتابخانهای مجهز و تخصصی تاسیس کند که علاوه بر پاسداشت دستاوردهای گذشته، نظام اطلاع رسانی خود را روزآمد نماید. بدینسان کتابخانه تخصصی وزارت امورخارجه در شکل جدید و حوزه ای وسیع تر در مهرماه 1378 تاسیس شد. کتابخانهای که در حمله اخیر آسیب دید.
مجموعه شهید باهنر در راستای اشاعه اطلاعات در زمینه تاریخ، فرهنگ، هنر و سایر موضوعات پیرامون ایران و با توجه به موقعیت خاص کتابخانه تخصصی و حضور بازدیدکنندگان داخلی و خارجی علاقمند به این حوزه، بخش جداگانهای را به کتابهای ایرانشناسی در بخش مرجع اختصاص داده است.